Antes de encontrar o sucesso mainstream no Universo Cinematográfico da Marvel, o Homem de Ferro era um personagem muito mais especializado. Essa popularidade fora dos quadrinhos foi acompanhada por seu status de nicho nos quadrinhos, com o personagem, apesar de seu status de bilionário, sendo um personagem da lista B na melhor das hipóteses. Esse status foi radicalmente alterado, assim como o Universo Marvel em geral, pelo evento House of M de 2005.
Esta alteração na história do mundo teve os mutantes como a força dominante na Terra, com a opressão interespécies desta vez sendo contra os humanos. Uma das maiores mentes da humanidade ainda era Tony Stark, mas House of M mudou fortemente seu relacionamento com sua armadura, seu pai e o mundo em geral.
Conforme estabelecido no principal de Brian Michael Bendis e Olivier Coipel House of M série, o evento reconfigurou o universo para que os humanos fossem uma espécie oprimida publicamente que servia aos caprichos dos mutantes. Isso aconteceu quando uma distraída Scarlet Witch ativou seus poderes de alteração da realidade em uma escala mais ampla do que nunca, reescrevendo o mundo no processo. Nesta nova continuidade, Tony Stark foi talvez a mente mais brilhante da humanidade, mas ele ainda era apenas um homem. Ele ainda era incrivelmente rico, embora suas criações ainda fossem supervisionadas pelos mutantes governantes, como a família homônima de Magneto, a House of M.
Ao contrário do universo mainstream, o pai de Tony, Howard, ainda estava vivo, embora estivesse aposentado de dirigir os negócios da família. Receber responsabilidades de negócios muito mais tarde na vida e nunca ter a tragédia de perder o pai tornou o Tony deste universo muito mais mimado e indolente. Até Howard observa isso, com essa versão do alcoolismo de Tony sendo causada pelas repreensões constantes de seu pai.
Conforme detalhado em Greg Pak e Pat Lee's Homem de Ferro: Casa de M , Tony e Howard são as estrelas da série de televisão Sapien Death Match , que os coloca em combate de gladiadores enquanto pilotam gigantescos macacões de batalha mecânicos. O traje de Tony é uma armadura dourada opaca, parecida com a armadura do Homem de Ferro Mark I e Mark II do universo 616. Juntando-se a eles no show está Johnny Storm, cujo traje pode emitir enormes rajadas de fogo, e maquetes dos robôs Sentinel. Neste universo, os Sentinelas foram reprojetados para caçar e atacar humanos, com qualquer ação contra os modelos 'oficiais' sendo uma ofensa passível de punição.
Nos bastidores, Tony cria uma armadura do Homem de Ferro para seu uso pessoal. Fundido no clássico esquema de cores vermelho e dourado, esta armadura comercializa as tradicionais vigas repulsoras de mão ou canhões montados no braço. Isso, junto com seu design mais volumoso, faz com que se pareça vagamente com a versão Geração 1 do Megatron. Impedindo uma frota de Sentinelas de matar humanos inocentes, o Homem de Ferro se torna um símbolo da resistência humana e um terrorista aos olhos dos senhores mutantes do mundo.
Trabalhando para Tony Stark neste mundo está Hank Pym, que, como Tony, ainda é um humano. A pesquisa de Pym o leva a ser capaz de isolar e mapear o genoma mutante, com as implicações perigosas dessa descoberta tornando-a potencialmente ilegal. Depois de quase ser demitido por Tony e Howard, Pym desaparece, e quando o recém-apelidado Homem de Ferro o rastreia, ele percebe como a descoberta de Pym pode ser perigosa. Pym havia criado várias bombas que afetaram as pessoas próximas com o gene X, forçando-os a um colapso genético sempre que as bombas eram ativadas.
Depois de interceptar as bombas e parar seu pai e vários drones, o Homem de Ferro foi cimentado como um potencial salvador para o Homo Sapiens. Howard revelou a Tony que seu verdadeiro propósito era sempre liderar a humanidade na luta contra os mutantes. Magneto apareceu durante a confusão e matou Howard Stark, mas o Homem de Ferro ainda se recusou a matar o overlord mutante. Este status como a principal figura de personagens da Marvel não relacionados aos X-Men seria refletido mais tarde com o lugar do Homem de Ferro no MCU, e agora mais do que nunca, ele é o rosto de heróis não-poderosos no Universo Marvel em geral.
