O Assassin's Creed franquia sempre contou sua história da perspectiva da Ordem dos Assassinos. Com a Ordem dos Templários defendendo a paz por meio da remoção do livre arbítrio, sempre ficou claro quem está certo. No entanto, há um título que mostrou a perspectiva da Ordem dos Templários - e como um traidor quase destruiu a Fraternidade Colonial dos Assassinos.
Assassin's Creed Rogue apresentou um jovem assassino chamado Shay Patrick Cormac, que era membro da Fraternidade Americana pouco antes da Guerra dos Sete Anos. Ele e seu amigo Liam O'Brien foram encarregados de caçar artefatos que a Ordem acreditava estarem ligados às Peças do Éden. Eles existiam muito antes do nascimento do Credo e detinham um poder tão grande que, caso os Templários ganhassem o controle de pelo menos um deles, eles poderiam escravizar toda a humanidade.
A dupla conseguiu localizar um artefato em um antigo templo abaixo de Lisboa. No entanto, a tomada de Shay desencadeou um terremoto que matou e deixou milhares de pessoas presas. Essa experiência o levou a acreditar que os Assassinos não se importam com os inocentes, agora os vendo como o oposto dos heróis que ele pensava que eram. Shay deu as costas à Ordem, colocando sua vida em risco enquanto seus associados o caçavam. Ele finalmente encontrou seu caminho para o Rito Colonial da Ordem dos Templários e, a partir daí, aliou-se ao inimigo jurado do Assassino e jurou evitar que seus antigos associados encontrassem outro templo.
Durante a Guerra dos Sete Anos, Shay perseguiu seus antigos parceiros assassinos com o Grande Mestre Templário, Haytham Kenway. Haytham era filho do assassino pirata Edward Kenway, mas ele foi criado para seguir os Templários. Com o passar dos anos, Haytham e Shay ganharam uma posição firme nas colônias e venceram a Guerra dos Sete Anos para os Templários. Ele também eliminou alguns dos membros mais poderosos da Fraternidade Colonial.
O clímax de Assassin's Creed Rogue viu Shay matando seu velho amigo Liam e Haytham, aleijando seu líder, Achilles Davenport. Por sete anos, os Assassinos ficaram desorganizados e sem liderança enquanto Shay e os Templários controlavam as colônias nas sombras. Levaria sete anos até que o filho de Haytham, Connor, chegasse e continuasse de onde Aquiles parou, eliminando a ameaça dos Templários na América e ajudando na vitória do país contra a coroa britânica durante um dos conflitos mais importantes da história, a Revolução Americana.
Cormac continuou trabalhando com a Ordem dos Templários, caçando artefatos antigos que os ajudariam a ganhar uma vantagem contra os Assassinos. Enquanto Connor liberava as colônias, Shay estava em Paris, com a tarefa de matar um Assassino que segurava uma caixa sagrada que poderia desvendar segredos antigos e que existia desde o assassino chinês Shao Jun. O assassino que ele matou era o pai de Arno Dorian, um assassino que ajudaria a libertar Paris em Assassin's Creed Unity . Mesmo que Shay Cormac não tenha destruído a Irmandade Americana de Assassinos inteiramente, ele mostrou como eles podem quebrar rapidamente quando um deles muda de lado.